我正在尝试将networkx与Python结合使用。当我运行该程序时，出现此错误。还缺少什么吗？

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")


Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 13, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable



我现在遇到了另一个错误：

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")




/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable



我现在遇到了另一个错误：

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")




/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable


评论

在没有运行X服务器的情况下生成matplotlib图的可能重复项
将调用移至其他导入上方的matplotlib.use（'Agg'），特别是应在导入matplotlib.pyplot
之前
@IvoBosticky评论也为我解决了这个问题：唯一令人误解的是“在其他进口商品之上”。显然，您需要先导入matplotlib ...这是对我有用的整个设置：import matplotlib // matplotlib.use（'Agg'）// import matplotlib.pyplot as plt

#1 楼

主要问题是（在您的系统上）matplotlib默认情况下选择使用x的后端。我在其中一台服务器上遇到了同样的问题。对我来说，解决方案是将以下代码添加到任何其他pylab / matplotlib / pyplot导入之前都可以读取的位置：

import matplotlib
# Force matplotlib to not use any Xwindows backend.
matplotlib.use('Agg')


替代方法是将其设置为您的.matplotlibrc

评论

重要说明：导入pyplot之前，需要先调用.use。因此，例如，如果您只是尝试导入pyplot，则需要先导入matplotlib，调用use，然后再导入pyplot。

–seaotternerd
13年8月8日在9:15
上面的评论将通过此答案进行更多说明。

–艾奥尼斯·菲利皮迪斯（Ioannis Filippidis）
2014年2月28日在6:15
您如何“在您的.matplotlibrc中设置”？

–tommy.carstensen
15年7月5日在20:32
后端：〜/ .config / matplotlib'/ matplotlibrc中的agg（例如，请参见http://matplotlib.org/faq/troubleshooting_faq.html#locating-matplotlib-config-dir）。另请参见matplotlib.org/users/customizing.html，该文件在页面底部具有示例配置文件。在该页面上找到“ agg”，您将看到所需的配置选项。

– Reinout van Rees
15年7月6日在8:48
作为参考，这是解释此内容的matplotlib文档的链接。 （+1，很好的答案，对我有很大帮助！）

– Tim S.
16-2-4在20:24

#2 楼

作为Reinout答案的补充。

解决此类问题的永久方法是编辑.matplotlibrc文件。通过

>>> import matplotlib>>> matplotlib.matplotlib_fname()
# This is the file location in Ubuntu
'/etc/matplotlibrc'


找到它，然后将该文件中的后端修改为backend : Agg。就这样。

评论

专家提示：将$ MATPLOTLIBRC设置为您想要在其中放置自己的matplotlibrc的目录。

–肯尼斯·赫斯特（Kenneth Hoste）
13年8月29日在18:19
有点像这样的问题，但我想服务器是否总是无头工作，修改配置文件是有意义的。这会对matplotlib的功能产生任何副作用吗？

–布鲁斯·约翰·詹纳·劳索（BruceJohnJennerLawso）
16/09/13在1:45


我在Web服务器上运行matplotlib，所以这就是我的答案。我还没有注意到任何副作用。

– Spitz
17年11月25日在12:14

#3 楼

明确的答案是花一些时间正确准备执行环境。

准备准备执行环境的第一种技术是使用matplotlibrc文件，这是Chris Q.明智的建议。在该文件中设置

backend : Agg


。您甚至可以控制matplotlib并在其中查找matplotlibrc文件的方式和位置，而无需更改代码。

准备执行环境的第二种方法是使用MPLBACKEND环境变量（并通知您的用户可以使用它）：

export MPLBACKEND="agg"
python <program_using_matplotlib.py>


这很方便，因为您甚至不必在磁盘上提供另一个文件即可完成此工作。我采用了这种方法，例如，在持续集成中进行测试，并在没有显示器的远程计算机上运行。

将您的matplotlib后端硬编码为Python代码中的“ Agg”就像用大铁锤将方钉锤打入圆孔中，相反，您本可以告诉matplotlib它必须是方孔。

评论

在这种情况下，第二种技术看起来最优雅。

–德米特里·卡巴诺夫（Dmitry Kabanov）
17-10-17在20:22
使用MPLBACKEND为我解决了它。绝对是最优雅的方式！

–SaturnFromTitan
18年5月18日在4:32

#4 楼

通过Spark使用matplotlib时出现错误。 matplotlib.use('Agg')对我不起作用。最后，以下代码对我有用。在这里更多

import matplotlib.pyplot as plt.
plt.switch_backend('agg')


评论

这很好用，没有对用于导入matplotlib和其他库的顺序的限制。

–PabTorre
17年5月5日在15:40
在Spark上运行时，是否必须将其限制为在头节点上运行，还是在工作程序节点上运行时使其运行？

–萨卡
17年9月24日在6:57
我在django项目中使用了它，这是我可以使其工作的唯一方法。

– HenryM
18年2月3日在16:28

#5 楼

我将重复@Ivo Bosticky所说的话，但可以忽略。将这些行放在py文件的非常开头。

import matplotlib
matplotlib.use('Agg')


否则会出错

*/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/__init__.py:923: UserWarning:  This call to   matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,*


这将解决所有展示广告问题

#6 楼

我发现此代码段在X和非X环境之间切换时效果很好。

import os
import matplotlib as mpl
if os.environ.get('DISPLAY','') == '':
    print('no display found. Using non-interactive Agg backend')
    mpl.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt


评论

我认为，尽管它不能直接回答问题，也可以回答未提出的问题，但它是一种比接受的解决方案更好的解决方案。

–荒木大辅（Daisuke Aramaki）
17年2月14日在11:53

#7 楼

登录服务器以执行代码时，请使用以下代码：

ssh -X username@servername


-X将摆脱没有显示名称和没有$ DISPLAY环境变量的情况
错误

:)

评论

我需要使用'-X'来保存.png图像。非常感谢。

–不
2012年12月12日在22:02


如果ssh超时，或者由于某种原因需要断开连接，则将导致长时间的失败。请注意，如果连接的客户端进入睡眠状态，甚至可能会发生超时。

–posdef
16年12月13日在16:00
您可以通过添加-o ServerAliveCountMax = 120 -o ServerAliveInterval = 30来防止超时，这将使ssh客户端每30秒发送一个空数据包，最长1小时。

– Alex
19年7月15日在15:42


#8 楼

您在什么系统上？看起来您的系统具有X11，但未正确设置DISPLAY环境变量。尝试执行以下命令，然后重新运行您的程序：

export DISPLAY=localhost:0


评论

但是为什么需要设置显示变量，我远程登录到该服务器，它应该做的就是生成一个PNG文件？？？

–krisdigitx
2010年5月10日上午10:41
@krisdigitx，如果您已远程连接，请不要设置显示变量；而是在连接时使用“ -XY”标志。为了显示，它需要知道将图像发送到哪个Xserver。在这种情况下，它将是您计算机的显示器，而不是远程计算机。使用“ -XY”标志会使SSH自动将DISPLAY变量设置为指向连接计算机的显示。

–迈克尔·亚伦·萨菲恩（Michael Aaron Safyan）
2010年5月10日14:12
@krisdigitx，我同意，这样做很奇怪；我的猜测是，它使用X11绘制图像，然后使用X11保存结果。

–迈克尔·亚伦·萨菲恩（Michael Aaron Safyan）
2010年5月10日14:14
使用$ DISPLAY的此设置在运行Ubuntu 16的EC2上不起作用-无法连接以显示“ localhost：0”

–PabTorre
17年5月5日在15:39

#9 楼

import matplotlib
matplotlib.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt


对我有用。

#10 楼

要检查的另一件事是您当前的用户是否有权连接到X显示器。就我而言，不允许root用户执行此操作，并且matplotlib抱怨同样的错误。

user@debian:~$ xauth list         
debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1  ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xauth add debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1 ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xterm


源：http://www.debian-administration.org / articles / 494 https://debian-administration.org/article/494/Getting_X11_forwarding_through_ssh_working_after_running_su

#11 楼

为确保您的代码可在Windows，Linux和OSX上以及具有和不具有显示器的系统之间移植，我建议使用以下代码段：

import matplotlib
import os
# must be before importing matplotlib.pyplot or pylab!
if os.name == 'posix' and "DISPLAY" not in os.environ:
    matplotlib.use('Agg')

# now import other things from matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt


信用：https：// stackoverflow.com/a/45756291/207661

#12 楼

对于Google Cloud Machine Learning Engine：

import matplotlib as mpl
mpl.use('Agg')
from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages


，然后打印到文件：

#PDF build and save
    def multi_page(filename, figs=None, dpi=200):
        pp = PdfPages(filename)
        if figs is None:
            figs = [mpl.pyplot.figure(n) for n in mpl.pyplot.get_fignums()]
        for fig in figs:
            fig.savefig(pp, format='pdf', bbox_inches='tight', fig_size=(10, 8))
        pp.close()


和创建PDF：

multi_page(report_name)