通过pip安装时，Python GDAL软件包缺少头文件

extensions/gdal_wrap.cpp:2853:22: fatal error: cpl_port.h: No such file or directory
compilation terminated

#1 楼

selimnairb的答案很接近，但是除非安装了libgdal-dev，否则您将没有标题：

sudo apt-get install libgdal-dev

完成后，

export CPLUS_INCLUDE_PATH=/usr/include/gdal

export C_INCLUDE_PATH=/usr/include/gdal

，然后

pip install GDAL

编译运行完成，我的虚拟环境中有GDAL。 ew！

（编辑2018）注意：
为确保安装正确的版本并避免出现任何问题。
使用gdal-config --version检索该版本。
然后：

pip install GDAL==version

#2 楼

由于某种原因找不到头文件。也许您是在虚拟环境中操作，或者由于某种原因它们不在应有的位置。无论如何，您都可以在通过pip安装gdal时指定包含目录。

首先下载python的gdal：

pip install --no-install GDAL

在更高版本的pip中（> = 9.0.0）pip install --no-install不存在：

pip download GDAL

，然后指定标头的位置：

python setup.py build_ext --include-dirs=/usr/include/gdal/

然后安装它：

pip install --no-download GDAL

在更高版本的pip（> = 9.0.0）中不存在pip install --no-download：

sudo python setup.py install --include-dirs=/usr/include/gdal

这是安装gdal python的另一种方法：

打开IDLE之后的

$ sudo apt-add-repository ppa:ubuntugis/ubuntugis-unstable
$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install python-gdal

：

from osgeo import gdal

，您一切顺利！

#3 楼

在遵循了此建议的子集之后，这就是我如何安装Python GDAL 1.11.0（该解决方案应与版本无关，请参阅下文）的方法，以便通过pip在Ubuntu 14.04上工作：



安装依赖项：

 sudo apt-get install libgdal-dev libgdal1h
 

通过传递include进行pip安装路径（用于系统范围安装的带有sudo的前缀），并指示pip安装与系统安装的GDAL版本匹配的版本：

 pip install --global-option=build_ext --global-option="-I/usr/include/gdal" GDAL==\`gdal-config --version\`
  

评论
来自selimnairb和Paul Whipp的更高评分的答案在Ubuntu 15.10上对我不起作用，而这个答案对我有用。



 –rhunwicks

 15年11月17日在10:34 
在从@nickves答案中添加不稳定的存储库后，第二行对我有用。谢谢大家！



 –帕特里克·威廉姆斯（Patrick Williams）

 16年5月24日在19:54 
谢谢，这最终对我有用。尽管在尝试尽可能严格地坚持cartodb安装时必须进行一些修改，但最终还是将其用作我的最终工作安装命令：sudo pip install --no-use-wheel -r python_requirements.txt- -global-option = build_ext --global-option =“-I / usr / include / gdal” python_requirements.txt指定了gdal的旧版本。我怀疑老实说这会很重要，但是整个pip安装集成功完成了。 U 12.04x64



 –vaxhax

 16年7月25日在21:32



 

#4 楼

在Linux上将Python软件包gdal安装到virualenv

GDAL为GEO相关操作提供了很好的工具包。但是，
在Linux上将其安装到virtualenv并不是一件容易的事。

此食谱描述了如何做到这一点。


note

我在Python包中使用小写gdal，而在
一般系统范围的库中使用大写GDAL。


需求


允许使用osgeo库（通过gdal Python软件包安装）到
virtualenv
允许在Linux Ubuntu上安装

安装方法

有多种方法用于安装。一个需要编译
，并且要花几分钟的时间。

另一个需要使用pygdal程序包的轮包，而且速度非常快。

关于GDAL软件包和版本

GDAL是用于GEO相关计算的基于C（++）的通用库。 >
GDAL实用程序可以在整个系统范围内安装，这使得共享库可用，但不能安装Python软件包本身。

GDAL的版本不同，每个Linux发行版可能<
默认安装其他版本。

Python软件包gdal需要编译，并且在基于Linux的系统上安装并不容易，因为它期望设置很少的环境变量。这使得安装到virtualenv更加困难。 > Python软件包gdal替代了GDAL，后者完全安装了与pygdal相同的东西，但是以更加虚拟化的方式进行安装。gdal的版本反映了相关的gdal版本。因此，在系统中安装pygdal
1.10.1版本时，您应该安装GDAL版本1.10.1。

Python软件包GDAL（以及pygdal）使用名为
gdal的root python软件包。并具有一组子模块，其中一个是pygdal。

如果需要，可以安装和使用默认版本的osgeo以外的其他子模块。这超出了本说明的范围。

车轮包可以交叉编译，这也超出范围。

将osgeo.gdal安装到系统中

/>由于GDAL需要存在GDAL共享库，因此必须先安装
。

假设尚未安装pygdal，则致电GDAL会抱怨
并给您提示如何跟进：

$ gdal-config --version
The program 'gdal-config' is currently not installed. You can install it by typing:
sudo apt-get install libgdal-dev

按照提示进行安装：

$ sudo apt-get install libgdal-dev

每个发行版都可以使用GDAL的不同版本。要找出使用哪个
，请使用：

$ gdal-config --version
1.10.1

现在您已经知道，已安装gdal-config且版本为1.10.1（版本
可以

从源代码包安装GDAL（需要编译）

当前，仅在tar.gz软件包中提供GDAL，该软件包包含
软件包源，需要编译。

，假设pygdal的版本为pygdal，并且我们的virtualenv已被激活：

$ pip install pygdal==1.10.1

它可能需要一个虽然需要完成，但是否需要numpy，这可能还需要一些编译。只需等待。

检查是否已安装：

$ pip freeze|grep pygdal
pygdal==1.10.1.0

从现在开始，您可以根据需要在Python代码中使用osgeo软件包。
与通过GDAL Python安装软件包的方式完全相同。

为1.10.1创建滚轮软件包


注意，则必须为完全相同的车轮包创建
架构，必须匹配：


CPU架构
OS（Linux / Windows）

在我们的情况下，它还必须匹配gdal的版本

可以根据需要在虚拟环境中进行以下步骤。

首先，确保已安装轮包：

$ pip install wheel

假设您已经安装了pygdal，并且它的版本为1.10.1： >
之后，您将找到子目录wheelhouse，其中应包含带有扩展名`whl`的软件包
：

$ pip wheel pygdal==1.10.1.0

从wheel软件包安装GDAL

从车轮格式化的软件包安装要快得多（与分钟相比，是一秒钟
），因为它不需要编译。

请注意，带有车轮软件包的目录可以有任何名称，我们将使用
名称wheelhouse。

首先激活virtualenv。

请确保您在wheelhouse di修复两个必需的轮包
（用于GDAL和pygdal）。

确保已安装pygdal，并且版本与numpy的版本匹配。 ：

$ ls wheelhouse
numpy-1.9.1-cp27-none-linux_x86_64.whl
pygdal-1.10.1.0-cp27-none-linux_x86_64.whl

-f操舵室应指向带有whl文件的目录。

无需安装GDAL，它将被安装自动。

#5 楼

是的，在运行PIP之前执行以下操作似乎可以正常工作：

导出CPLUS_INCLUDE_PATH = / usr / include / gdal

导出C_INCLUDE_PATH = / usr / include / gdal

#6 楼

pip安装gdal的问题在于，它仅获取绑定，而不是整个库，因此可能会很棘手。解决它的一种方法是使用pip命令下载-但不安装。然后，从配置文件中调整标题位置。然后你点安装。 meh。

我遇到了同样的问题，但意识到编写一个结构脚本来重新编译gdal并生成python绑定将花费更少的时间。您甚至可以从中获得filegdb的好处。继续使用我写的文字或将其调整到您的内心满意。

#7 楼

过了一会儿，这提供了include路径，而不必退出pip安装：可以使用环境变量来设置include路径。

头文件位于/ usr / include / gdal中，在运行pip之前发出

export CPLUS_INCLUDE_PATH=/usr/include/gdal

。

#8 楼

在左右寻找解决方案之后，即使在无权访问系统软件包的virtualenv内，也可以在Ubuntu 14.04上使用它：



安装依赖项：

sudo apt-get install libgdal-dev libgdal1h libgdal1-dev

设置编译器标志：

export CFLAGS=$(gdal-config --cflags)

安装与系统库相对应的版本（在编写Ubuntu Trusty时使用的是1.10标头）：

pip install GDAL==1.10.0

#9 楼

在其存储库中具有GDAL 2.0.2的Fedora 24上，我必须安装Python软件包，如下所示：

pip install \
  --global-option=build_ext \
  --global-option="-I/usr/include/gdal/" \
  GDAL==2.0.1

#10 楼

现在，您可以使用标准GDAL python绑定pygdal的virtualenv和setuptools友好版本。

#11 楼

我在Mac上也遇到类似的问题。解决方法如下：

首先，我使用virtualenv设置了虚拟Python 2.7环境。 Python发行版安装在名为“ env”的目录中。

然后我用fink安装gdal

fink selfupdate
fink update-all
fink install gdal

我还安装了gdal-开发人员，但可能不需要，因为它可能已经与gdal一起安装。

我使用以下命令检查了安装的版本：

gdal-config --version

在我的安装中，它产生了结果
1.11.1

gdal的fink安装将cpl_port.h头文件安装在/ sw / include / gdal1中。检查您自己的安装。然后我输入：

export CPLUS_INCLUDE_PATH=/sw/include/gdal1
export C_INCLUDE_PATH=/sw/include/gdal1
env/bin/pip install pygdal==1.11.1

这似乎对我有用，但我尚未测试安装。

#12 楼

尝试在Mac（OS 10.10.5）上安装python GDAL绑定时遇到类似的错误。我使用“完整”下载从http://www.kyngchaos.com/software/frameworks安装了基本的GDAL软件。我必须设置三个环境变量。

导出C_INCLUDE_PATH = / Library / Frameworks / GDAL.framework / Headers
导出CPLUS_INCLUDE_PATH = / Library / Frameworks / GDAL.framework / Headers
export LIBRARY_PATH = / Library / Frameworks / GDAL.framework / Versions / Current / unix / lib

最后一步是将/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs添加到我的PATH中。

echo'export PATH = / Library / Frameworks / GDAL.framework / Programs：$ PATH'>>〜/ .bash_profile

之后，该pip可以安装GDAL蟒蛇。希望这会有所帮助。

#13 楼

这些gdal软件包0.10.1非常适用于Ubuntu 12.04：
https://launchpad.net/~ubuntugis/+archive/ubuntu/ubuntugis-unstable/+sourcepub/4353415/+listing-archive-extra

其他ubuntu版本的gdal软件包0.10.1：
https://launchpad.net/~ubuntugis/+archive/ubuntu/ubuntugis-unstable/+packages?field.name_filter=gdal&field.status_filter= Published＆field.series_filter =

#14 楼

要回答问题的virtualenv特定方面，请注意：

pip3 search gdal

与python绑定的pygdal软件包所需的版本不同的GDAL版本。


下面是我在最新版本的Fedora（20和23）上得到的东西。

GDAL                      - GDAL: Geospatial Data Abstraction Library
pygdal                    - Virtualenv and setuptools friendly version of
                            standard GDAL python bindings

#15 楼

使用单个命令通过Pip安装

假设已安装GDAL开发包并且头文件版本正确，则从PyPI存储库安装GDAL所需的唯一命令如下：

pip install --global-option=build_ext --global-option="-I/usr/include/gdal" gdal

这显然假定头文件的位置是/usr/include/gdal。

安装最新的GDAL

为了安装GDAL使用上面的pip命令，头文件的版本必须与pip进行构建的版本相似。 GDAL的更新二进制参考文件位于：https://trac.osgeo.org/gdal/wiki/DownloadingGdalBinaries。

如何在OpenSUSE上安装

按照上面的链接，还有一个URL嵌入在指向OpenSUSE 42.1的最新GIS软件包集的更进一步的向下位置http://download.opensuse.org/repositories/Application:/Geo/openSUSE_Leap_42.1/Application:Geo.repo />

zypper ar -f <URL>

替换为适当的包装。如果不使用zypper，请访问https://trac.osgeo.org/gdal/wiki/DownloadingGdalBinaries了解更多信息

#16 楼

我在Windows 10上遇到了同样的问题。
经过一些实验，我找到了该解决方案。


下载并安装Python 3.6（如果未安装）
安装更改环境变量
PYTHONPATH=c:\python36
PATH=C:\python36\Scripts\;C:\python36\;%PATH%

从https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#gdal下载* .whl以获取正确的python版本

下载并安装http://landinghub.visualstudio.com/visual-cpp-build-tools


pip install *.whl（步骤2中的* .whl）

#17 楼

如果您使用的是Docker，我们将开源容器，从而简化了GDAL和Python 3的使用。该容器捕获了上述步骤，可让您在应用程序中快速使用GDAL。 python

#18 楼

这种方法对我有用：

sudo apt-get install libgdal-dev
export CPLUS_INCLUDE_PATH=/usr/include/gdal
export C_INCLUDE_PATH=/usr/include/gdal
pip3 install gdal==$(gdal-config --version)

或作为Dockerfile的一部分：

RUN apt-get update && \
DEBIAN_FRONTEND=noninteractive apt-get install -y \
                libgdal-dev \
                python3-pip
ARG CPLUS_INCLUDE_PATH=/usr/include/gdal
ARG C_INCLUDE_PATH=/usr/include/gdal
RUN pip3 install gdal==$(gdal-config --version)

#19 楼

如果您正在使用Travis CI，并且需要Python的最新版本的GDAL，则以下示例显示了.travis.yml文件的以下部分：

 language: python

env:
  global:
    - CPLUS_INCLUDE_PATH=/usr/include/gdal
    - C_INCLUDE_PATH=/usr/include/gdal

before_install:
  - sudo add-apt-repository -y ppa:ubuntugis/ppa
  - sudo apt-get -qq update
  - sudo apt-get -qq install libgdal-dev gdal-bin

install:
  - pip install gdal==`gdal-config --version`
 

#20 楼

如果您正在运行基于Debian的发行版，则可以通过软件包管理器使用GDAL python库，并且可以简单地通过

sudo apt install python-gdal或sudo apt install python3-gdal
安装

#21 楼

在Docker容器中的conda的Ubuntu 16.04上（jupyter堆栈）

apt-get update
apt-get install libgdal1-dev -y
gdal-config --version
export CFLAGS=$(gdal-config --cflags)
pip install GDAL==1.11.2

#22 楼

在ubuntu中，一种为python3安装最新gdal的简单解决方案：通过libgdal-dev安装库文件，并通过python-gdal安装python包装器。

sudo apt-get install libgdal-dev
sudo apt-get install python3-gdal

对于python2：

sudo apt-get install python-gdal

#23 楼

您可能还会遇到内存使用方面的问题。

运行pip install gdal==2.2.3 gcc时，它会进行编译，从而提高了内存使用率。编译器失败，并显示类似


的消息'x86_64-linux-gnu-gcc'失败，退出状态为4


要修复它，您需要添加更多ram或释放一些。

#24 楼

这就是我在python3的virtualenv上的Ubuntu 18.04（我假设16.04相同）上安装gdal 2.x（非3.x）的方法：

# add the apt repo 
sudo add-apt-repository -y ppa:ubuntugis/ubuntugis-unstable
sudo apt update
sudo apt upgrade -y

# install gdal==2.2.3 on system
# NOTE: these may change in the future, you can check versions with: 
# apt-cache policy <package name>
sudo apt install -y libgdal20=2.2.3+dfsg-2 libgdal-dev=2.2.3+dfsg-2
sudo apt install -y gdal-bin=2.2.3+dfsg-2 python3-gdal=2.2.3+dfsg-2

# ensure that it worked
gdalinfo --version  # should print 'GDAL 2.2.3, released 2017/11/20'
# start a python3 interpreter NOT inside your virtualenv
>>> from osgeo import gdal
>>> gdal.__version__  # should print '2.2.3'

# activate virtualenv 
source .venv/bin/activate

# install inside virtualenv
export CPLUS_INCLUDE_PATH=/usr/include/gdal
export C_INCLUDE_PATH=/usr/include/gdal
pip3 install gdal==2.2.3

# ensure that it worked
# start a python3 interpreter INSIDE your virtualenv
>>> from osgeo import gdal
>>> gdal.__version__  # should print '2.2.3'

希望这会有所帮助！